次氯酸鈉不僅呢過消毒防病,并且能對茶垢、血跡、焊劑、大小便斑跡等洗衣粉難以去除的特殊污物有達到即除的功效。次氯酸鈉的滲透能力比較強，它能滲入到動植物的細胞壁、病毒的外殼，使菌體蛋白變性而致死。它在分解時是可以形成生態氧的，次氯酸鈉分解反應的關鍵步驟是原子氧的釋放，光或加熱有利于原子氧的形成。當溫度低于25℃時，分解緩慢，高于30℃時，分解速度明顯加快。
高濃度的次氯酸鈉液體還可以用于剝離設備及管道上附著的沾泥.次氯酸鈉的滅菌原理主要是通過它的水解形成次氯酸，次氯酸鈉是強氧化劑和消毒劑，它是通過取源于廣泛價廉的工食用鹽稀溶液，次氯酸產生出的氯離子還能顯著改變細菌和病毒體的滲透壓，次氯酸鈉的水解會受pH值的影響，當pH超過9.5時就會不利于次氯酸的生成，而對于ppm級濃度的次氯酸鈉在水里幾乎是完全水解成次氯酸，其于99.99%。
溫度和紫外光對次氯酸鈉的穩定性有很大影響。隨著溫度或光照(尤其是紫外光)的增加，次氯酸鈉溶液的分解率明顯加快。次氯酸鈉工業使用過程中，為了獲得比較好的氧化效果并易于進行控制，次氯酸鈉通常是要稀釋使用的，特別是在次氯酸鈉濃度不夠高的情況下，次氯酸鈉改性后鎳基催化劑中孔比較豐富，使次氯酸鈉更為容易被吸附到催化劑的內表面，這就提高了次氯酸鈉與催化劑的實際接觸面積，
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